Ban lãnh đạo Vườn gồm có Giám đốc và Phó Giám đốc.

Giám đốc: Nguyễn Vũ Linh

Phó Giám đốc: Lê Doãn Anh

     Giám đốc chịu trách nhiệm trước Cục trưởng và trước pháp luật về mọi hoạt động của Vườn; trình Cục trưởng ban hành quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của các Trung tâm, Hạt Kiểm lâm trực thuộc Vườn; quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn của các Phòng trực thuộc Vườn; ban hành quy chế làm việc và điều hành hoạt động của Vườn.

     Phó Giám đốc giúp Giám đốc theo dõi, chỉ đạo một số mặt công tác theo phân công của Giám đốc, chịu trách nhiệm trước Giám đốc và trước pháp luật về lĩnh vực công tác được phân công.